据调查，在中国大陆的地表水中抗生素含量十分惊人，主要河川长江、珠江、黄埔江都检出抗生素，南京鼓楼区的自来水中甚至也能检出抗生素阿莫西林。
根据中国媒体的调查报道，地表水中含大量抗生素的原因是企业排放污水，以及养殖业滥用抗生素。例如，山东鲁抗医药大量偷排抗生素污水，浓度超过环境背景值一万倍。而江苏南京被称为「鸭都」，但南京养鸭场因喂药过多，养鸭人都不吃自己养的鸭子。
报道引述中国科学院广州分院的专家表示，广州珠江中抗生素的浓度是欧美等国家河流中相应抗生素含量的三至四倍，广州污水处理厂排出的处理后的污水中，抗生素含量也显着高于国外。
专家分析，水源中的抗生素主要有三大来源：第一是人体排出后进入废水系统；第二是动物饲料中常添加抗生素，还有地方养殖场投放抗生素，直接进入水体；第三是药厂和医院的医疗废水。
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