奥巴马亚洲之行的首站选在东京，如同希拉里-克林顿国务卿今年二月上任后出访亚洲也是首站停东京一样，凸显美日盟友关系的重要。奥巴马抵达东京后马上和日本首相鸠山由纪夫进行了一个半小时的会谈，在接下来的记者会上，奥巴马谈到双方会谈的内容：
奥巴马说，“通过这次出访，而且是在我的总统任期内我想明确一点的是，美国是一个太平洋国家，我们会加强在这一地区的参与。我和首相先生也提到，我们将加强我们的盟友关系和伙伴关系，为保证地区和平和繁荣做出努力。”
双方在会谈中还谈到清洁能源技术，气候变化以及建设无核化世界的问题。双方表示将在清洁能源的研发方面加速合作和交流，而且为了减少二氧化碳的排放量，美日双方同意在2050年二氧化碳排放量减少80%，同时在同一年争取全球的排放量减少50%。另外，在无核化问题上，日本和美国政府呼吁拥有核武器的国家在解除核武器的过程中，尊重透明，可查和不可逆转的原则。美国政府决定在其国家安全战略中减少核武器扮演的角色，日本和美国政府敦促其他拥有核武的国家也这么做。
明年将是美日安保条约签署五十周年。为了表明日本对美国的支持，日本政府几天前宣布向阿富汗提供50亿美元的援助，主要用于扶持国家重建的民用项目。日本首相鸠山由纪夫在九月份上任以来，还强调和美国维持一种“平等的伙伴关系”，在这次记者会上鸠山再次提及这个目标：
鸠山说，“总统先生很自然地提到我们是平等的伙伴关系。证明之一就是我们在会谈中谈到日本所关心的议题之一就是冲绳美军基地的迁移问题。我们双方同意成立一个工作小组以便尽快解决这个问题。”
美军在日本的驻军四万七千多人，有一半驻扎在冲绳。冲绳人总把美军基地和犯罪，噪音，污染联系在一起，70%的冲绳人希望美军基地搬走。这个议题成为最近日本大选中的热门议题，鸠山也曾保证要替冲绳民众着想，所以这一议题也成为最近美日关系的焦点之一。
几乎是在奥巴马抵达东京的同时，数十名支持西藏的人士来到东京市中心的青年会馆门前进行抗议示威，表达他们的诉求。他们口喊着“改变西藏”，“改变中国”的口号，打着代表独立西藏的雪山狮子旗以及呼吁奥巴马关注西藏问题的标语。这次活动的组织者，达赖喇嘛在日本和东亚的代表拉巴措郭告诉本台说：
“今天的和平示威活动是支持西藏的日本人士和在日本的藏人发起的。虽然天气比较冷，但是还是有五十多人到场表示他们对西藏事业的同情。这次活动的目的就是公开宣布我们向奥巴马总统写了一封公开信，呼吁奥巴马在过几天访问中国，会见胡锦涛时，不要忘了中国的人权纪录和西藏问题。”
奥巴马在11月14号离开东京飞往新加坡出席亚太经合组织的高峰会，并将在15号开始对中国进行为期三天的正式访问。
自由亚洲电台申铧东京报道。