距离台湾五都选举投票日仅剩四天，陈菊在高雄竞选连任的声望保持领先，但九月份高雄因台风来袭、风雨成灾的第一时间，陈菊人在官邸休息，却由幕僚在行程表上记录为外出勘灾，经人检举之后，被检方依伪造文书起诉。陈菊对此的反应是“没有评论”。她说：“我对这些事情一清二楚，我不想对被人抹黑之事表达意见，没有评论，人民心中自有公道。”
选举进入倒计时阶段，陈菊低调回应幕僚犯错，但竞选对手、属无党籍的杨秋兴竞选总部，为此动员地方领袖大声回击。杨秋兴竞选总部发言人曾尹俪说：“我们一定要再一次来检讨这个说谎的市政团队，陈菊市长，你难道不知道自己的行程在哪里吗? 事情经过九天之后，再经由高雄市议员质询，才承认当时你在睡觉，请陈菊把真相说清楚。”
杨秋兴竞选团队总干事黄明河则指出:“人的体力总是有限的，假使高雄市区豪雨成灾之时，陈菊市长真的是在官邸睡觉，其实还可以原谅，但是，如果再继续说谎，那又怎对市民交代？”随后，杨秋兴竞选团队同声呼吁陈菊市政团队下台，以示对市民负责。
代表国民党竞选高雄市长的黄昭顺，则看向因同案被控渎职的陈菊，日前由检方以不起诉处分，批评司法单位有失公允。黄昭顺表示：“我的心里有一点痛，因为司法制度没有理有‘办小，不办大’，我们同时向检方呈交十一项（市长涉渎职）事证，检方又怎能只选择其中一项或两项就做成侦结?我们知道检察长的妻子是扁政府行政院长张俊雄办公室主任朱富美，在选前关键时刻即予结案，我要请问，是否企图以司法影响选举?”
国民党立委邱毅从台北南下高雄为黄昭顺辅选，向来被台北政坛封为“爆料天王”的邱毅，带来陈菊手机通联记录，质疑陈菊说谎。邱毅说：“检察官认定陈菊手机在9月19日（台风来袭）下午3点10分到4点没有基地台显示，很明显地，当日下午2点48分到4点30分该手机没有任何通话记录，经判断是关机状态。我要请问陈菊，高雄市在9月19日那天何时开始淹大水? 据了解，那天下午3点开始狂风骤雨，而陈菊不也对外宣称，她在当天下午2点23分回到官邸吗?假设她是通过电视了解灾情，但陈菊手机直到3点10分还是关机状态，这样合理吗?”
以上是自由亚洲电台记者萧融发自高雄的报道。