相关官员向传媒透露，马英九出访洪都拉斯行程单纯，不会前往其它国家访问，而去程与回程预计将过境美国西岸。但正值台湾的立委针对全面开放美国牛肉政策表达不满，并且进行修法，禁止部分美国牛肉进口，是否引起美国不满，并影响马英九过境美国的规格，引起外界关注。外交部长杨进添只简单表示，马英九的出访与美国牛肉争议是两回事。
此外，军方过去每年对退休将领发放新台币一亿多元的年终慰问金，遭到监察院纠正，军方决定取消，引发退休将领不满，并扬言不支持马英九连任。对此，总统府发言人王郁琦表示，政府行事不能只考虑政治，否则将影响长远发展，军方应与退休将领充分沟通尽可能寻求谅解。
自由亚洲的特约记者容屹发自台北的报道