两岸清华大学百年庆典在星期天同步举行，虽然同为清华大学， 但待遇却大相径庭，与台湾清华低调庆典不同，北京清华进驻人民大会堂，作为清华校友的中共总书记、国家主席胡锦涛致辞祝贺母校的百年育人成就。
在庆典当天，中共中央政治局九大常委中的六位亲自前往，但却遭到各界质疑，认为是对权力的崇拜。清华大学也制作了百年校庆特刊，封面是清华大学毕业的名人头像排列而成的清华大学百年校庆图标，包括胡锦涛、朱镕基等领导人，还有梁启超等历史名人，此图像被网友批评像是排灵位，做墓碑。
一位清华的学生林先生向本台表示：“这个封面是为了百年校庆做的，形状就是学校礼堂的形状，不光是我，如果你去人人网去看，清华的同学对这个封面多数也都是反感，这个是赤裸裸的对权力的崇拜，特别是他把钱学森放在下面，如果是钱学森看到这张照片，他就一定不会问，为什么清华大学培养不出大师，因为（校刊封面）顶上就不是大师（是胡锦涛等人）。”
清华大学的前身是清华学堂，始建于1911年， 曾是由美国退还的部分庚子赔款建立的留美预备学校。1912年，清华学堂更名为清华学校。1925年设立大学部，开始招收四年制大学生。1928年更名为国立清华大学，并于1929年秋开办研究院。
清华大学的初期发展，虽然渗透着西方文化的影响，但学校十分重视研究中华民族的优秀文化瑰宝。一度成为中国教育界的骄傲。
以清华国学研究院四大导师王国维、梁启超、陈寅恪、赵元任等为代表的清华学者，主张“中西兼容、文理渗透、古今贯通”，形成著名的“清华学派”，对清华的发展产生了深远的影响，培养出了一大批高水平的学术大师，在中国近现代学术史上占据着重要的地位。
从上世纪中叶中共执政以来，清华强调人才培养要“又红又专”，曾经最具自由思想，独立精神的大学一度成为“红色精英的摇篮”。
英国《金融时报》中文网特约撰稿人马国川接受本台采访时表示：“清华大学49年蒋南翔当校长以后，非常清楚，就是要培养又红又专的人才，就是要为这个体制服务的人才，这个是双向的，就是他主动地向这个体制输送人才，外部这个体制也需要他输送人才。”
马国川认为：“官本位”下的中国大学在中国，大学以所谓的“ 教育产业化”为由，想方设法创收、忽视教育质量而一味追求金钱的倾向已十分严重。例如，历史学家章开沅痛心疾首地说，高等教育进入了新一轮“大跃进”，大学成为重灾区，大量教师把精力用在争招生数额、项目经费、科研课题、学位授予点上，根本无心考虑提高教育和科研水平。”
近日，北大打算对“思想偏激”的学生进行会商，让马国川十分感慨，他表示除了法治倒退之外，中国高校的自由空间也不断萎缩，而“五四”将至，他希望清华的师生都能以培养独立思考为最重要的课题，而不是校庆时有多少名人高官到场或又培养了若干专家人才。
北京媒体人朱学东表示，一所不朽的大学不应因社会变迁和政权更替，而改变独立自由的探索精神。
以上是自由亚洲电台驻香港特约记者心语的采访报道。