据外媒报道，新成立不久的中国中央国家安全委员会，日前开始低调清查在华境外非政府组织，以便对其更严格地进行规范。分析人士认为，有关当局这样做是担心这些境外组织在中国推广公民意识等普世价值。
法新社6月20日报道称，最近几年在华的境外非政府组织如雨后春笋一样快速发展，有时会和政府部门发生冲突，尤其是和一些敏感群体如性工作者、吸毒人群合作的非政府组织。
报道说，6月17日，山西省"运城市阳光农廉网"的政务公开栏目发布了《长直乡境外非政府组织和活动情况调查摸底工作方案》，方案称："根据中央国家安全委员会统一部署，2014年5月至7月底拟对在华境外非政府组织及其活动情况开展一次全国范围的全面、彻底调查摸底，摸清底数，为下一步加强规范管理打下基础。"
《观察者》网站周五刊登题为“国安委部署摸底调查在华境外非政府组织”的报道，“凤凰网”等多家中国媒体也发布了类似消息，但稍后《观察者》的文章被撤除， "凤凰网"的转载也被删除。而"运城市阳光农廉网"上的原文也无处可寻。
在中国的非政府组织“益仁平中心”负责人陆军目前正在纽约访问。
陆军周五接受自由亚洲电台记者电话采访时表示，这一消息看来是被泄露的内部通知。但是，陆军说 ，有关当局正在低调清查在华境外非政府组织确实是事实，前段时间就有警察到益仁平中心郑州办公室进行调查。
“要我们同事填写一个境外驻华机构情况调查表，确有其事，而且是紧锣密鼓的操作当中。”
陆军表示，一个社会必须靠“政府系统”、“商业系统”和非政府组织的“公益系统” 这三大系统相辅相承，才能健康正常地运转。他个人并不担心这次的“全面清查”会对在华境外非政府组织产生太大冲击，因为类似的清查已经发生过多次。陆军说：
“比较典型的是05、06年中亚、东欧颜色革命之后，应该说通过那两年政府的调查监控，政府也明白了非政府组织不是一个政治力量，不是破坏性的力量，是建设性的力量，2011、12和13年在中国的非政府组织的生存环境有好转。这次如果真是国家安全委员会下令调查，他们可能是太外行了。”
据报道，6月10日，中央纪委驻社科院纪检组组长张英伟炮轰中国官方重要智库中国社科院存在四大问题：第一、穿上学术的隐身衣，制造烟幕；第二，利用互联网炮制跨国界的歪理；第三，每逢敏感时期，进行不法的勾连活动；第四，接受境外势力点对点的渗透。
中国社科院亚太与全球战略院副研究员高程几天后在微博透露：“昨天返所，开始填表调查摸底个人与海外机构，特别是NGO组织和基金会的来往和财务关系了”。
深圳当代社会观察研究所所长刘开明表示，在华境外非政府组织的合作对象除了一些民间组织外，最大的合作对象其实是各大高校和政府部门。
“应该从管控的思维模式来理解这个问题，因为现在在中国有很多国际NGO有项目，总体是为各个部门增利。有关部门，特别是安全维稳部门并不太了解，我觉得他们先是想掌握情况，至于是否收紧，还不知道。”
刘开明表示，他相信国安委开始全面清查在华境外非政府组织，是担心这些非政府组织会用项目合作、学术交流、学者访问等方式，在中国推广公民意识等普世价值。刘开明说：
“从去年以来整个政治环境比较收紧，在这种情况下调查NGO，尤其是境外的NGO，是很正常的。”
法新社的报道说，除了山西外，至少有广东、福建等四个省份展开了类似的清查行动。据了解，中央国家安全委员会于去年11月成立，委员会主席是中国国家主席习近平。
（记者： 唐琪薇 / 编辑：马平）