1979年以台湾军官身分从金门前线逃往中国大陆的林毅夫，能否返台数度成为热议焦点。他在纽约再次强调欲返台祭祖愿望，惟情势非他能掌控。“我当然还是很想回去（台湾）！”。林毅夫在美中关系全国委员会一项论坛后回答中央社记者询问时，停顿一下后做了简短回答。至于是否再度提出申请或希望台湾政府如何处理等，林毅夫沉默些许后，不做回应。
根据台湾官方资料，林毅夫曾两度申请返台，第一次是1996年，第二次是2002年因父亲过世，林毅夫以奔丧为由申请返台，惟皆无法如愿。
中国国务院台湾事务办公室曾在2012年呼吁台湾政府让林毅夫回台祭祖。依旧因军方立场坚定而作罢，林毅夫也未再提出赴台申请。林毅夫妻子陈云英已多次以自由行方式返台，也替林毅夫赴宜兰老家祭祖。
随着台湾即将举行总统大选，林毅夫能否在马英九政府卸任前返台，成为两岸关系另类指标。（责编：胡汉强）