2月13日，星云法师的弔唁仪式在台湾佛光山举行，蔡英文总统出席仪式并颁发褒扬令。而中国前宗教事务局局长叶小文因涉及宗教迫害，申请入境台湾遭到陆委会拒绝。
星云法师圆寂赞颂典礼13日在佛光山举行，数以万计的信众送星云法师最后一程。台湾的总统蔡英文亲自致祭并颁赠褒扬令提及，“综其生平，尽瘁国际教育文化交流，力促世界宗教共融合作，上善若水，渥惠摇芳；遽闻尧龄圆寂，怆怀轸悼，应予明令褒扬，用示政府崇礼大德之至意。”
在典礼前，两岸为了弔唁团申请隔空掀战。台湾的陆委会核发星云法师中港亲友、信众及宗教人士共计120人入出境许可证。
叶小文遭指破坏宗教自由 台湾陆委会拒其入境
然而，针对中国前宗教事务局局长叶小文的入境申请，台湾官方考量其曾遭民间团体指控涉及迫害宗教自由，并在2009年来台参加“世界佛教论坛”期间，发生民众陈抗冲突事件，为避免引发台湾社会不必要的纷扰并确保典礼顺利圆满完成，因此援例未予同意其入境。
除此之外，中国国台办、统战部共38人来台申请也遭陆委会拒绝。
中国国台办发言人朱凤莲11日批评“民进党罔顾人道主义，粗暴拒绝中国弔唁团赴台。”
台湾行政院长陈建仁出席赞颂典礼后接受媒体联访表示，台湾已经准了所有在大陆，还有港澳的信众、亲属都能够来到台湾参加这个盛会，但他说，“至于中共官员，由于他们没有遵照、尊重我们以往已经建立好的机制来提出申请，这个弔唁团没有提出这样的机制向我们申请，所以才没有办法出席。”
星云法师因许家屯被中国列入黑名单 叶小文曾牵线见江泽民
无缘登台的叶小文与星云法师的渊源要回溯到前新华社香港分社社长许家屯事件。台湾的《中国时报》引述星云法师在《星云大师全集》中谈到，1990年5月1日，他收到讯息，自香港出走的许家屯想借住美国西来寺。当时，星云只想到救苦救难是佛教的精神便一口答应，未料因此遭北京误会，认为他不该收留“叛离大陆”人士，并被江泽民领导的中共列入黑名单，让他想回乡探亲都没有那么容易。
2006年，星云法师前往杭州参加第一届“世界佛教论坛”开幕典礼，透过叶小文和日本蒋晓松等人的安排，在上海与江泽民首度见面。星云说道，“当时江说的第一句话是，‘过去的种种，一切到此为止’。”而这大概是指许家屯事件带来的误会。
台湾铭传大学新闻系主任孔令信接受本台访问时表示，当时正好是六四天安门事件后，许家屯非常危险，中国共产党全党要迫害他。星云法师伸出援手，如果没有“关系”的话，许家屯就会像白色恐怖一样被处理掉。在星云法师与江泽民会面事件中，叶小文时任宗教局长，处理两岸宗教事务。他尤其是在佛教界非常娴熟，也身负统战任务。
孔令信说，“叶小文在这一块做了穿针引线功夫，这就是他们之间的关系，他们早就有互相来往，但是私底下不会是那么明显。”
叶小文涉反人类罪 台湾办与不办都为难
然而，律师黄帝颖指出，调查法轮功遭迫害的国际组织“追查国际”曾在2005年1月19日发布的《追查中共官员及文字打手一览表》名单中包括叶小文；并表示，已依据《禁止酷刑犯入境美国法案》（Anti-Atrocity Alien Deportation Act），将其犯罪记录递交各国海关和移民部门。
黄帝颖律师对本台表示，叶小文被控反人类罪，一旦入境，台湾司法机构有权对其追究刑事责任。陆委会发现叶小文夹带在弔唁名单内，拒绝其入境，其实也避免了政治上的高度纷争。
“因为法治上我们有应作为的义务，作为民主国家本来就对反人类罪有侦查的义务，但是他的身份特殊，是中共的高官，如果真的对他进行逮捕、侦查或是后面的司法追究，确实会引起敏感的政治问题。”黄帝颖补充说道。
黄帝颖认为，对岸是指假弔唁之名，行政治操作之实：“陆委会拒绝叶小文入境，避免了一场法治与国际政治高度争议事件。”
记者：黄春梅 责编 许书婷 何平 网编：瑞哲