台灣繼第一次武漢撤僑包機在二月初載回兩百多名台胞後，第二次撤僑包機因兩岸就名單優先順序等議題僵持，經私下協商多時，周二（10日）落實第二次兩架包機，共接回四百多名滯留武漢台灣人。中央流行疫情指揮官陳時中證實，台灣提的百多個優先名單都搭上包機，兩岸同意檢測陰性沒有發燒才能登機。（鍾廣政 台北報道）
自從二月初第一次武漢撤僑包機之後，台灣當局一直不願意透露後續包機安排。微信社群「武漢新天地」周一（9日）晚傳出訊息，確認再次有包機，成為傳媒關注焦點。
新任國民黨主席江啟臣，以立委身分質詢行政院長蘇貞昌包機問題，但蘇貞昌堅持要由中央流行疫情指揮中心宣布。
江啟臣說：我們還在大陸武漢的六百多個台灣民眾，是不是今天包機會回來？
蘇貞昌說：委員，讓滯留武漢的國人同胞能夠早一點回來，是政府一直努力在做的。我們一直在談的專機，堅持三個原則：第一‧弱勢優先、第二‧檢疫優先、第三‧量力而為。為了讓國人同胞能夠早日回來，我們用盡心力，現在談已經漸漸有一個成果。
江啟臣說：這個有沒有確定，哪一方面還沒有確定？
蘇貞昌說：一確定由指揮中心完整的向國人報告。
隨後，中央流行疫情指揮官在記者會中宣布，華航的撤僑包機已經起飛，台灣方面也作出萬全準備。
今次共有兩班撤僑包機，除了華航飛去接回台胞外，中國東方航空也會接續飛航第二個班次。
衛福部長、中央流行疫情指揮官陳時中表示，台灣方面過去一個月以來提出的弱勢優先名單，都被陸方接納，而且中方更答應為乘客做好相關健康檢查。
陳時中說：大概我們最初提出來的名單，除了少數可能有其他情況外都包含在裡面，我們最主要是要掌握名單，名單當然是雙方有一定的協調，因為當地的情況，我們這邊也不是百分之百能夠掌握，當然也要參考互相的意見。不過，我們本來的優先名單都會在裡面。這裡面了解的之後，我們最需要知道的，這次我們希望這次能夠檢測過PCR（核酸檢測）是陰性，沒有發燒的情況才能夠登機。
對於第一次包機之後，要等一個多月才飛第二次，前陸委會副主委、文化大陸社會科學院院長趙建民表示，第一次包機是由台商協會與對岸溝通，突顯兩岸沒有溝通渠道，未來兩岸在其他問題上，可能發生誤判或擦槍走火的可能性非常高。
趙建民說：究竟是怎樣談回來不得而知，因為政府也不公開，顯然政府也沒有角色，如果有角色他一定會說明我們是怎麼談的。顯然第二次包機華航飛過去一班，中國大陸的東航也飛過來一班，看起來雙方是有一點妥協。這個妥協是不是政府委託給譬如我們的旅遊協會去談，很可能是這個樣子，到現在我們不曉得，因為政府不講。旅遊協會是民間單位，雙方取得一些諒解使得這一次才有可能，這證明我們政府的兩岸政策是很有問題的。
依照台灣方面安排，第一架包機周二晚上降落後，需要三小時處理乘客，之後第二架包機才能起飛，預計周三（11日）清晨才會抵達台灣，兩班包機乘客分別安排入住台中三處秘密隔離中心。