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台灣教育部的教科書編審委員會，提出新的高中歷史課程，並且決定在2006年開始使用。新的課程對於台灣的地位，採用《舊金山和約》和《中日和約》，依照這兩個條約，日本政府祗在聯合國宣布放棄對台灣的管轄權，但並沒有表示台灣歸還中國的字眼，因此台灣是不屬於中國的獨立國家。
新版歷史教科書更把歷史分為台灣史和中國史兩部份，而有關中華民國創立部份，列入中國古代史。依照這個劃分，未來台灣高中學生所知道的，是中國有一個叫孫中山的人，他創立了一個叫中華民國的國家，這個國家是在中國的古代，和學生居住的地方無關，而且中華民國是台灣的敵對國家。
台北市長馬英九今天在行政院會，和教育部長杜正勝辯論，馬英九認為，開羅宣言、波茨坦宣言與一九四五年九月，日本向盟軍投降時所呈的降服文書，應是三合一文件，三者合在一起才是有拘束力文件，因此高中歷史教材不能只提出開羅宣言無法律約束力的論調。
國民黨發言人張榮恭表示，民進黨的做法，是另一個層次的台獨，將為台灣帶來災難。張榮恭說：過去幾年來，其實蹟象也蠻清楚的，民進黨政府對於中華民國是“借殼暫住”，目標是脫殼而出。如果拿掉中華民國，走向台灣獨立，我們認為會造成台灣的災難。今天我們在報上看到的這些情形，實際上就是一種教育台獨，台獨教育的路線，我們認為，這是台獨腳步的加快。