台灣傳媒引述消息報導﹐總統陳水扁2003年公布大陸導彈數目﹐導致三十多名台商間諜被捕。軍事情報局承認當年有大批台諜被捕。
台灣中國時報引用大陸網站和消息報導，2003年11月30日，總統陳水扁為求選舉勝﹐利連任，推動飛彈公投，首次公布解放軍部署496枚飛彈和位置，還特別強調來源是台灣的情報。
中國時報報導，大陸方面隨即報復性地自十二月中旬到隔年元月，一口氣抓了三十餘名台諜。這批台諜大多是台商，成為兩岸情報較勁的代罪羔羊。這批台商，其中17人，被大陸判處10年以上有期徒刑。
前國防管理學院院長帥化民認為，由於陳水扁所提出的數字太過準確，所以才引北京懷疑，一舉破獲台灣間諜網。帥化民說：“(飛彈)數字報告的越精確，你就等於相對告訴中共，我這裡面派了有匪諜、特務，在你這邊蒐集情報。”
國民黨立委郭素春指，陳水扁出賣了台灣的特務還不承認，這批台商間諜被抓得很冤枉。郭素春說：“陳水扁這種國家領導人，一天到晚‘大嘴巴’，說了就賴，賴不走就推。”
國防部軍事情報局發布新聞稿表示，中國時報所指的是2003年的舊案，軍情局已照規定妥善處理。聲明稿指，大陸在東南沿海部署大量飛彈瞄準台灣，眾所週知，而且由衛星照片就可以証明。聲明認為，傳媒將陳水扁發言，牽連台商入獄，顯然與事實不符。(自由亞洲電台鍾廣政 台北報導)